Hi Everyone,

I am trying to coarse-grain a protein with 100 chains using martinize2 but got an error during the grompp minimization step stating
Fatal error:
An input file contains a line longer than 4095 characters, while the buffer
passed to fgets2 has size 4095. The line starts with: '; CCCCCCCSSSCSSCSCSS'

the martinize2 has built all the 100 chains in a single file rather than separate files. I tried with -sep also it still dint build the files separately.

Could anyone help me out with this error?

Thank you

with regards
Srinivasan

Hi Fabian,
Thank you for your reply. I don't see any commented line in the itp file. It looks like this ;

This file was generated using the following command:
; /home/srinivasan/.local/bin/martinize2 -f output_unwrapped_ter.pdb -o single-ubq.top -x 1UBQ-CG.pdb -dssp /usr/bin/dssp -p backbone -ff martini3001 -sep
; martinize with vermouth 0.9.1
; The following sequence of secondary structure
; was used for the full system:
; CCCCCCCSSSCSSCSCSSSCCCSSCSSCCSCCCCCSSSSCCCCSCCCCCCCCSSCCCCSCCCCSSTTCCCCCSSCCCCCCCCCCCSCCSCSSSSSSCCCCCSSCCCCCCCSSCCCSCCSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCSCCSCCSSSSSSSCSCCSSSCCCCCCSSCSSSCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCSCSSCCCCCSSCSCCCCCCSCSSSCCCCCCCCSCCCSSCCSSCCCCCCCSCCSCCCSCCCSCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSSCCSSCCSSCCCCCCSSCCCCCCCSSCCCCSSSCCSSSCSSCCCCSCSSSCCCCCCCCCSSSCCCSCSSSSSCSSSCSSSCCCCCCCCCCCCCSSSSCCSCCCSSCCCCCCCCSCCCCCSSSSCSSCCCSCCCCCCCSSSCCSCCCSSSCSSCSSSSSSCSCCCCSCCCCSSCSSCCCCTTSSCCCCCCCCCCCCSHHHHSCCCSSCCCCCCSCCCSCCCCCSCCSCCCSSSCCCCSSSSSCCCCCCSCSSSTTSSSCCCCSSCCCCCCSCCCCCCCCCSCSSSCCSSCSSCCSSSCCSSSCSSSCCCCCCCCCSSSCCSCCCCCCCCCSCCSSSCCSSSSCSCCSCCSCSSCCSCSSTTCCCCSSSCCCCCCCCCSSSCCCCCSSCSCSSCCCCCCSSSSCSCCCCCCSCCCCCSSCSSSSCCCCCCCSSSSSCCSSSSSTTCCCCCSSSCCSCCCCCCSSCSCCCCCCCCCCCCSSSSSCCSSSSSCCSCCCSCCCSSCCCCSCCCCCCCSCCCSSCCCCCSCCCCCSSCCCCCSSSCCCCCCCCCCSCCCCCCCCSTTTCCCCSCSTTCSSSSSSCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCSSSCCSSCCCCCCCCCCCCCCSSSCCTTTTTTCCCCCSSCCCCCCSSCCCSCCSSSSCCCCSCCSSCCCCCSSCCSSSSCSCCSCSSSCCCSCCCCSCCCCCCCSSSSCSSCSCCSCSSCCSSSSSSSSCSSCCSSCCCCCTTSSSCCSCCCCSCCCCSCSSSSCCCCCCCCCSCCCSSSSSSCSSCSSSCSSCCCCCSSSCCCCSCCCSSSBCSSSSCBCCCCSCCCSCCSCCCCSSTTCCCCCCCCCSSCSSSSCCCCCSSCSSCCCSSCCCCCCCSSCCCCCSSCCCCCCSCCCCSSCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCSCCCSCSSSCCCSCSCCCCCCCSCCSSCCSSCSCCCCSCCCSSCCCCCSSTTCCCCSCCCCTTCSSCCCCSCCCCCCCSSCCSSSSCCCSCCCCCCCCSSCCCCCCCCSSCCCCCCSSSSCCCCCSSSSCCCCCSTTTCCSSSSSCCCSSCSSSSSSSCCSSSCCCCCCCSSCCCCSSSSSCCCCSCCCCSCCCCCSSSSCCCCCCCCCCSSCSCSSCSSCCCSSCCCCCCSCSCSCSSCCCCSSSCTTTTCSCCSSSSSCCSSSCCCCSCCCSSSCCCCCCSSCCCCCSSSSSCCCSCCCCCCCCCCCSCSSSSSCCSSSSCCCCCCCCSCCCCCSSSSSCCSSCSSSSSCCCCCCCSSSSSCSSCCCTTCCCCCSSSCCCSCCCCCSSCSCCCSSSCCSSCSSTTSCCSCCCCCSCCSSSCSSCCCSSCCCSCSCSBTTBCCCCCCCCCSCCSSCCCCCCCCSCSCCSSCCCCCCCCSSSCCCCCCCSCCCCCCCSSTTTTCCCCSCCSSSCCSSCSCSCCCCCCCTTSCCCCCCCSSCCCSSSSSCCCSCSCSCCTTCCSSCCCCSSCSCCSCCSSSSCSCCSCCCCCCSCSSCCCCCSCCCSSCCCCCCCCCCSSSSSSCCCCSCCCSSCCCCSCCCSSCCSSCCSCCCCCCCCCSSCSSCCCSCCCCCCSCCCCSSCSSSCSSCCCCCCCCCCSCCCSSSCCSSSCCCCSCSSCCCCSSSCCCSCCCCCCCCSCCCCCCCCCCSCCCCCCSCCSCCSCSSCSCCCSCCSCCSSSCCCSSCSSSCCCCCCCTTCCSCCSSCCCSCCCSSCSCCCSSSCSCCCCCCSSCCCCTTTTSSCCSSCSSCCCCCCSCCCCCSSCCCCCCSCSSCSCCCCSCSSSSCCCTTCSCCCCCSSCCCCSSSCCSSSCCCCSSCSSCCCSSCCSCCSCCCCCSSSCCCCSCCSSTTCCCCSCCCCSSSCSSCCCCSSCSSSTTCSSSCCCCSCCSCCCCSSSCCCCCCCCCCSSSCSSSSSTTCSCSCCSSSCCCSCCCCCCCCCCCTTCCCCSSCCCSCCSSCCSSSSCSCCSSCCSSCSSCCSCCCCCSTTSCCCSSCSSCCCSSCCCCTTSCSSCCCCSSSCSSTTCCCCCCCCCSSSCCCCCCSSCCCCCCCCCSCCSSSSCCSCCCCCCCCCSCCCCSCCCSSCSCCSCSCCSSSSSSCCSSCCCCCSCSCSSCCSSSCCSCSSSCSSSSCCCSSCCCTGGGCSCCCCSSSSCCCCCCCCCCCSSCSCCCCCCCCCCCSSSCSSSSCCCCSSCCCCCCSCCCCCCSSCCCSCCCCCCSCCCCSCCCCCCCCSSSSSSCSCSSSCCSSSCCCCCCSSCCSSSSCCCCSCCCCCCCCCCCSSSCCCCSSCCSSCCCCSSCCSSCSSCCSCSCSCCCCCSSSSSCCCCSSCCSSCCCCSSSSSCCSSCCCSSSSSSCCCCCCCCCCSSCSSCCCCCSSSCCCCCCSSCCCSTTCCCCCSSCCSCCCCSSSSTTCCCCCCCCSCCCSSCCCCCCCCCSCCCSSSSCSCCSSCCCCCCCCSCCCSCSSCSCCCCCSCCCCCCSSCCCCCSSCCCCSCCCCCCCCCTTCCCCCSCCSCCSCCCSSCCCSSSSSCCCSCCCSCCSCSCCCSSSSSCCCCCCSCCCSCCTTCCSSCSSSCCSCCCSCSSCTTCCCCCSSSCCCCCCCSSCSSCSSSCSSSSCCSSSCCSSCCCCCCCSSCCCCCCCSCSCCSSCCCCSCSCSCCCSSSSCSSSSCCCCCCCCSCCCCCCCCSCCSSSSCCSCCCCCSSCSCSSCCCCSCCCCCCCCSCSSCCCCCSSCCCCCSSSSSCSCCCSCCCCCCCCCCCCCCCSSSCSSCSCCCSSCCCCCCCSSCCSSCCCSSCCSCCCCCCSSSSSCCCSCCCCCCSSSCCCCCCCSTTCCSSCCSSCCSCCCCSCCSSCCCCCCCCSSCCCCCCCCSCCCCCCCSTTTTSCCCCCSSCCCCCCCCCCCCSCCCSSSCCCCSSTTCCCCCCSSSCCCSCCCCCCCSSSCCCCSCCCCCCCSSCCCCSSSCCCCCSSCCSSCCSSCCCCCCCCCSSCCSSSSCSSCCSSSSCCSCCCCSSSCSCCCSSSCCCSSCSSCCCSSCCCSCSSSCCCCCCCSSSSCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCSSCSCCCCCSSCCCCSSSSCCCSSCCCSSSCCCSSTTTTCCCSSSSSCCCCCCSCCCSSSSCCCCCCCCCCCSCSSSSCCCSSCCCSSCCSSCCCCCCSSSCCCCCCSSCCCCSSCCCCCCSCSCCCCCCCCCSSCSSSCSCSSCSSCCCCSSCCSCCCCCCCCSSTTTTCSSSCCSSCCSSSCCSCCCCSSCCSSSCTTSCSCCCCCSCCSSSSCCCCSCCSSCCCTTCCCCCSCCSSCCCCCSSSCCCCSCSSCSSSSCSSSCCCCSSSSCCSSSSCCCCCCSSCCCSSCSSCSCCSCCCSSCCCSCCSCSSCCCSSTTSSCCSSCSSCCCSSGGGCCCCCCCCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCSCCCCCCSCSCSCCCCCSSCCSCCCCCSSSSSCCCCCSSCCCCCCSSCCCCCCCSCCCCCCCCSSSSCCCCCSSCCSCCCCSSCSSCCSSSCCCCCSCCCCCCCCCCSSSCCSCSSSSCSSCCCCCCCCSSSSCSCCSCSSSSSCSSCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCCSCCCCSSCCCCCCSCSSCCSSSCCCCCCCCCCCSCCCCSCCSCCCCSSCSSCCCSSCCTTSCSSCCCCSCCCCCCCSSCCCCCCCSSSSCCCCSSCCSSCCSCCCCSCSCSSSCSSSSCCCCCSCCCSCCCCSCSSCSSCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCSSTTTCCSCCCCCCSSCSCCCSSCCCCCSSTTCCCSSCCCSSCCCCCSSSCCSSSCCCCCSSCSSCCCSSSTTSCSSSCCCCCCCCCSSCCCCSTTSCCCCCCCCCCCCSCCCCSSCCCCSSCSSCCCCCCCCCCCCCCCSCCSSCCSSSSSSCCCCSCSSCCCCCCCSSCCTTSSCCSCCSSSCCCCCCSSSCSSCCSSSCSTTSSSSSCCCSSTTCCCCSSCCSSCCSCCSCSSSCCCCCSCCCCCCCCCSSCCCCSCSCCSSSCCCCCCCCCSCSCCSSCCCSSCCCCCCSSCSSCCCCTTCCSCCCSSCCCCCCSCCSCCSSSSCCCCCSSSSSCSCCCCSCSSSSCCSCSSCBTTBCCSSCCCCSCCSCCSSCCSCCCCCCCSCCSSSCCCCCCSSSSCCCCCCCCCCCCSSCCCCCSCCSCCCCSSCCCCCCCCCSCCSSSCSCCCCCCTTTCCCCCSCSSSSSSCCCTTSCCCSSCCSTTCSSCCCSSCCCCCCCCSSSCSCCSTTSCCCSCCCCCCCCCCSSCCCSSCTTTSSSSSSSCCCCCCSSCCCCSSCCSSCCCCCSSSCCCCCCSCCCCCCCCCSCSCCCCSSSSCSCSSCCSSCCSCCCCCCCCCSSSSSCSSSSSCCCSSCSCCSSCCCCSSSCCCSCCCCTTTSCSSSSCCSCCSSCCSSSSCSSCSSSCCCCCCSSSCCSSSSCSSSCCSCSSCCCSSSCSSSCCCSCCCSCCSCSSSCCCSSCCCCSSCCCCCCCCSSCCCCCCSCCCCSSSSSSCCCSSSCSCCCCSSSCSSSSSCSSCSCCSCCCCCCCSCSCCSCCCCSSSSCCCCCCCCCSSCCCTTSCCCCCSCCCCCSCCCSSCSSCCCCSSCSSCCCSSCSSCCSSSSCCSSSSCCSSCCCSSSSSSSCCCSCCCSCCSSSSCCCCCCCCSSSCCCSCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCSSCCTTCSSCCCCCSCCCCCCCCCCSCCSCCSSSSCCCCCCCSCCCCCCSSSTTTCSSCCSSCCSCCCSCSSCSSSCSCCSCCCCCSCCCSSSCSSSSCSSCSSSCCSCSCSSSCCSSSSCCCCCCCCSCCCCCCCSSCCSSSSCCCSCCCCCCCCTTSSCCCSSSSSSSCCCCTTCCSCSSSCCCCSCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCCCCCSCSSCCCSSCCSCCCCSCSSSSCCCSCCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCTTSCCCCCCCCCSSCCSCSSTTTSSSCCSSSSCSSCSSSCSSCCCCCCSCCCCSSSCCCCSCSCCCCSSSTTCCCSCCSSSCSSCCSCCSSCCCCCCCSSSCCCCCCCSSSCCCSSSCCCCSSCCSCCSCCCCCCCCCCCSCCCSSCSSCSSSCCCCCCSSCCCCCCCCCCCSCCCCCCCCSSSSSSSCCSCSCCCCCCCSSSCCCCCCCCCSSCCCCCCSCCCSSGGGCSCCCCSSSCSCCCCSSSCCSCSSSCCSSCSSSCCCCCCCCCCTTCCCSCCCCCCCCCCCCCCSSTTSCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCSSCCSCCCSSCCCSCCCCCSSCCCSSCCCSCCCCSCSSCCSCCCSSSSCSCCCCCCCCCSSCCSCCCSCSSSCCCCSSSSCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSSCSSSSSCCSSCCCCCCCCCCCSSSSSCCSSCCCCCSCCSCCCCSSSCCCCCCCSSSCCCSSCCCCCCSSCCCCCSSCCCCTTTSCCCSSSCCSSSBTTBCCSSSCCSCCSSCCCCSSCCSSSCCSSCCCCCCCCSSCSSCCCCSSCSSCCSSSCCSCCCCCCCCSCCCTTCSCCCCCSCCCCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCSSSCCCSSCCCSCCCCSSSCSCCCCCCCCSCCCSCCCCCCCCCCCCCCCCTTCCCCCCSSSSCCCCSCCCCCCCCSSSCCCCSSSSCSCCCCCCSSSSSSCCCCSSSSSSCCCSSCCCSSSSSCCCCCCCCCCCCCCSSSSCCCCCCSSCCCCCBSSSSCCCCSSSSSSCCSCCSSCCCCCCSCCSSTTCCCCCCSCSTTCCSSSSSCCCCCCSSSCCCCCCCCCSSSCSSCCCCCCSSCSSSCCCCCSSCCCCCCCCCCCSSCSSCCCCSSSCCSSSSSSCCSSSSCCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCSCCSTTCCCCCCSSSCCCCSCCSCCCCCCSSSTTCCCCSCCCCCCCSSCCCCCCCSCCCCCSCSSCCCCCCCCCCSSSCCCSCSSCSCCTTSSSCCSSSCCCSSCSSSSSCCCCSSCCSCCCCSSCCCSSCSSCCSCCSCCCCSSCCCCCSSSSCCTTCSCCCCSCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCSCCSCCCSSSCCSCSSCSCSSSSTTCSSCCSCCCCCSCCCCSCCCCCSSCSCCCSSSSSCCCCCSCSSCCSSCSSCCSSCCSSSCCCSCCCCCCCCCCCCCSSSCSCCCCCCCCCSSCCCTTCCSCSSCCCCCSCCCCCCCCCCSSCSSCSSCSCCSSCCCCSCCCCSCSSSCCCTTCCCCCCCCCCSSCCCCSCSCCCCCSSSCCCSSSCCSSSCSSCCCSCSSCCSSSCCCCCCCCCCCCCCSCSSCCSSCCCSSSSCCCCCSSCCCCCCCCCCCCSCSSSTTTCCCCSCSCCSCCCCSSSCCCCCCCCCSCCSCCCCCSCCCSCSSCCSCCSSCCSCCSCCCCSCCSSCSCCCSSCCSCSSSCCCCSSSSCSSCSSSSCSSCSSSCSCSSCCCCCCCSSSSSCSSSCCCCCCCCCCSCSCSSCCSSSCCCSSCCCSSCSCSSSCCCCCSSSCCSSSSSCCSSCCSCCCCTTCSCSSCSSCSSCCSSSTTSCCCCCCCCCCSSCSSCCCSCCCTTSCSSCSSSSSSSCCCSSCCSSCCCCCSSCSSSSSCCCCCCCCSCCCCCCTTSCSSSSCSSCSSSSCSSSCCCSSCCCCSCCCSSCSSCCCSSCCCCCCCCCCCSSCCCCCCSCCSSCCSSTTCSCCTTTTSCCCCSCCCCSSSTTCCCCCSSSCCSCSCCCSSCCSSCCTTCCCCCCCCCCCCCCCCSCCSSCSCCCCCCCCSSCCCCCSCCCCCBCSSSCCSCSCCCSCCCCSCSSCCCSSCCCCCCSCCCSSCSSSCCCSSCSSSSCCCCCCCSSSSCCCSSSSSCSSCSSSSCCCCCCSCSCCCCSSCBSSSSCCCCCSSSCCSSSCSSSSCCCCCSSSCCCTTSSCSSSCCCSSSCCCCSCCCCCCCSSSCCCSSCCCCSCCCSSCSSCTTSCCCSCCCCSSSSCCCCSSCSSSSCCCSSCCCCCCCSSSCCCCCCSSCCCCSCCCSSCCCCCCCCCSSSCCCCSCCSCCSCCCSCCSSCSCCCSCCCCSCSCCCCSSCCSCCSSSCCSSCCCCCCSCCCCSSCSSCSCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCSCCCCCCSSSCSCCSSCSSSCCSCSSSCSSSCCCCSCCSCCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCSSCCSSCCSTTTSCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCSSCCSSSSSCSSSCCCCSCCCCSTTTCCCSCCCCCCSSCCCSCCCCCSCSSCCCCCSSCCCCCCCCCCCCSSSCCSSCCCCCCCCCCCCCCCCSSSSCSSCCSSSCSCCCCSSSSSCCCSSSSCCSCCCCSSSCCSSSSCCCCSSTTCCSCCCCCCCCCSSSCCCTTSSSCSCCCCSSCCSSCSCSCCSSCCCCCCSSSSCSTTSCSSSSSCCCSCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCSSCSCCCSSCSSCCSSSSCCCCCCSCCCSSSCCCCCCSSSCSSCCCSSCSSCSSCCCCCSCCSCCCSCCCCSSSCCCSSCCCCCSSCCCSSSSCCCCCCCCCCCSCCSSCSCCSCCCSSCCSSSCCCCSCCCCSSSSSSCSCCSSSCCCCSSCSSCCSCSCCCCCCCSCCSCCCCCCCCCCCSSSSCCSSSSSSSSSCCSCCSCCCCSCCSCCCSSSSSSCCSCCSSSCCCSCCCCSSSCCSSCSSSCCCCCCCSCSSCCSCSSCCCCSSCCSSCSCSSCSSSCCSSSSSSCCSSSSSCCCSSCCCCSSSCCCCCCCCCCCCSSSCCCCSSCCSSCCCCSSSCSSCCSCSSSCCSCSCCCSSSCCCCSSTTSCCCCCCSSSCCSSCCCCCCCCSCCSSCCCCCCCCCCCCCCSSCTTSSCSSCSSSSCCCCCCCCSCSCSSCCCSCCCSCCSSCCCSCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCSCCCCCCCCCCCCSSSCCSSCCSSCCSSCCCSCCCSCSSCCCCCCCCCCCCCCSCSSSSCCCCCSCCCCCSSCCCSCSCSSCSSCCCCCCCSCCCCCCCCSSSCCCSCSCCSSSCSCCCCCCSSSCCCCCSSCCTTSCCCCSSCSCCCSSSCSCCCCSCCSCCSSSCCCSSCSCSCSCCCCCCCCSSSCCCCCCCCCSSCSSCCSSCCCCSSCCCSSSCCCSCCSSSSCCSSCSSCSSCCCCCCCCSCSSCCCCCCCCSCCSCCCCCCSSSCCCCCCSSCSSSCCCCCSCCTTSSSCSSCSSSCCCCCSSCSCSCCCCSSCSSCCSSCSSCCCCCCCSSCSCCCCCCCCCCCCSCCCCSTTSCSCSCCCCCCCSCSSSCCCCCCCCSCCCSCCSCCSSSSCSCCCCCCSSCCCCCSSCCSCSSSCCSSCSCCCCCSCCCCCCCSSTTCCCCSCCCSCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCSSSSCCSSCCCCCSSCCCCCCSSSCCCSSTTSSSSCCCCCTTCCCSTTCCCCSSCSSCCSCCSSSSSCCSSCSSSSSSSCCCSSSSSCSSCCCCCSCCCSCSSCSSTTCSSSCCCCCCCCCSSSSSCSSCCCCSCCCSCCSSCCCCSCSCCCCCCCCCSCCCSSCCSCSCSSSCCSCCCCSCCCCCSSSCCCCCSSCCCCCSCCCCCSSSSCSSCCCCCCCCCCCCCCSCCCCSSSCSSCCCCCSCCCSSCTTCCCCCCSSCCCCCCSCSSSSSCSSSSCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCSCCCCCCSSCCCCCCCCSSSCCCSSSCCCCSSSCCSSSCCCCSSSSSSCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCSSCCBSSCCCCTTSSSCCCCCCSCCCCSSSSCCCSSCSCCSSCCCCSCCSSSSSSCCCCSCCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCSSSCSCCSTTCCCCCCSSCSSSSCCCCCCSSCSCCSSSCCCSCCCCCCSSCSSSCSSCCSSSCCTTSCCCCCCCSCCCCCCCCCCCSSSCCCCCCCCCSSSCCSSSCCSSSCCCCCSSSCCCCCSSCSSCSCCCCSSSCSSCCCCSCSSCCCCCSSCSSSCSSSSCCCCCCCSCCSSSCCSCCCCCCCCSSCCSCCCCSSCCCCCSSCCCCCCCSCCSCCCSSSCSSSCCCCSSCCCSSCCSSSSCSSSCCCCCCSSSSCCCCCSCCCSSSCCSSCCCSCSCSSCCCCSSSCCCCCCCCCSCCSSCSCSSSCCCTTSSSSSSCCCSSSSSSCCCCSCCCCSCSSCCCSSSCSSCCCCCCCCCSCSCCCCCCSSCCCCCSCCCSSSCCCSSSCSSCCSCSCCCCCCCSSCCCCCSSSSTTCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCCCCSSCSSCCCCSCCCCCSSSSSCCCSCSSSTTTCCCCCCSSSSSCCCCSSCCCSCCCCCCCSCCCCCSCSSSSCSSSCCCCCSSCCCCCCSSSSSSCCCCCCCCCCSCCCCCSCSSCCSTTCSCCSSTTTCTTCCCCSSCSCSSCTTSCCCCCCCCSSCCCCSCCCCCSSCCCSSCCCCSSCSSSSCTTTTCCSCSCSCCSSCCCSSSCCCCCCCSCSSSSCCCCCSSSSCCCCCSCCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCSSCCSSCSCCSCCCSCCCCCCCCCCSSSCSCSSSCSCCCSTTCCSCCSCCSCCSSCSSCCSSSSSTTCCCSSSCSSSSCSSSSCSSSSCCCCCSCCSCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCSSCCSCSSSCCCCCCSSSSCCCSSSSCSCCCCSSCCSSTTCSSSCCCSCCCSSCCCSSCCCCCCCCCCCSCCSSCCCCSCCCSSSSCCSCCCCCCCCCCSSSSCCSTTCSSCSCSSCCCCCCCCCCSSSCCCSSCCCCCCCCCCCCSCSSCSCCSSCCSCCCCSSSSCCSCCSSCCCCCSSSSCCSSSSSSSCCSSSSSCSSCSCCCSSCCCCCSCSSSSSSSSSCSCCSSCCSSCCSSSCCSCCCCCCSCSSCCCCCSSCCCCSSSSSSSCCCSSCCCCCSSCSCCSCSCSSCSCCCCCSSSSCSCCSSSSCSSCSSCCCCSSCSSCSSCCSCCCCCCSSCCCCSSCCCSSCCSSCSCCCTTSSSSCCCCSSSSCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCSSSSSSCCCCCCCCCCCSSCCSSCTTCSSSSSCSSTTSSCCCCSCCCCSSSCCSSCSCCSCSCCCSCSSSCCCCCSCCCCCSSCCCCSCCCSSTTCCCCSSCCCCCCCBTTBCSSSCCCCSCCCCCCCSSSSCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCCCCCSCCSCCCSCCCCCCCSCCCSCSSSCCCCSCCSSCCCSCCSCCCCCCCCCCCCSCCCCCCCCSCCCSCCCCSSCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCCCSCCSSCCCCCCCSSSSSCCCCSCCCCCTTCSSCCSSSSSSCCCSSCCCCCCCCCCCCSSSCCCCSCCCCCSSSCSCCCCCCCCCCCCCCCSSSCCCCSCCCSSCSSCCCCCCSCCCCCCSCCCCCCCCCCSSCCCSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCSSCSSSCCCCCCCSCCSCCSCSCSCCCSSSCCCCCSCCCSCCTTSCCSCCCCCCSCCSSSCCCCCCCCSSCSSCCCCCSSCSCCSCCCCCCCCCCCSSSCSSSSCCSCCCCCCSCSSSSSCSSCCCSSCCSCCCCSCCSSTTSSCSCSCCCSSSCTTCCCSSCSSCCCCSCCCSSCCCSSSCSSSCSSCCCCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSSSCCCSCCCCCCCSCCSCCCCCCSSCSCSSSSSCCCSCCSCCSSCSCSCSSCCCCSCCSTTSSSCCCCCCCCCSCCCCCCSCCSCCCCCCSCCCCCTTCCCCCCCCSSSCCCCCCCSCCCCCCSCTTCCCCSCSSSSSSSSCSSCSCCSSCCCCCCCCSSCSSCCCCSCCCCCCSSSCCCCSSSSSSSSCCCCCCCSSCCSCCCCSCCCCSSSSSSCSSCSCCCCCCSSSCCCCCCSSCCCCSSCCCSSCCCCCCCSSCCCCCCCSSSCCSCSCCCCCSSCSSCSCCSSSCSCCCCCCSCSSCCCCCSCCCCCSSSSSCCSCCCSSSSSSSCCCSCCSSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCSSCCCCCSCSSSCCCCCCCCCSCCSSGGGCTTCCCCCCCCSCCSSCSSCSSCCCCCCCCCCCSCCCCSSSSCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCSCCCCCCCCCCSCCSCCCCCCCSCSSSSCCCSSSCCCSCSSSCCSSSSSSCCCSSCSCSSCCCCSSCSSCCCCCCCSCSSCCSCTTCCSCSCSSSCCSSCCCCCCCCCCSCCSCCSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCCCCCCCTTCCCCSSSSSCCSSSCCCCSSSCSSSCSCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCCSCCSCSSCSCCCSCCSSCSCSTTSCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSSSSSSCCCCCCCCCCCCCCSSCCCCSSCCCCCCSSSCCCCCCSSCSCCCCCCSCCCCSCCSSSCSCSSCCCCCSSSCCSCCSCCSSSCCCCCSCSCCCSCCCCSSCCSSSCSSCCCCCCCSSSCCCCCSSCCCCCCCSCCCSSSCCCCCCCCCSSSCSSCSCSSCCSSSSSSSCCCCCCCCCSSCSSSCSCCSSSCSCCCCCSSSSCCSSCCSCSSSSSSSCSCCCSSSSCCSCSCCCCCCCCCSSSSCSSSCSSCCSCCCCCSCCSCSSCCCCCCCCCCCCTTCCCCCCCSCCCSSCCSSCSSSSCCSCCSCCCCCCCCCCSSCCSTTCCCTTSCCCSSCSSSCCCSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCCCCSSCCCCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCCCSCCSSSSSSCCCSCCCSSCSSCCSCCSSSSSCCCCSCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSSCCCSSCSCCCCCCCCCSCCCSSSCSCCCCCCCSSCCCSSCCCSCCCCCCSSSCCCCCCCCCSSTTSCSCCCSSCCCSCCCTTTTTSCCCCCSSCCSCCSCCSCCCCSSSCCCCCCCCCCSCCSSSCCCCSSCCCCSCCCCCCCCSSSCCSSCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSCSCSCCCCSCSCCCCCSCCCSSCSSCCSSSCCSCCCSSCSSCCCSSSSCCCCCCSSSSSCSSCCSSCCCCCSCCCCSSCCCSCCCCCCCSCCSSCCCCCCCCCCCCSSCSSCSCCSCCCCCCCCSTTTTSSCCCCCSSCCCSCCCCCSCCGGGCSSCCCCCSSCCCCTTCSCSSSCSSSCSSCCSSCCCSSCCCCCCCSSSSSCSSCCCCSCSSCCCSSSCCCCCSCCSSSSCSCCSCCCCCCCCCSSSCCCSCCSCCCCSSSCCCCCSSSCCSSSCCCSCSSSCSCCSSCSSCSSSSCCCSTTCSCSSCCCCSSSCSSSCCCCCSSSCCSCCCCCCSCCCCSSCCSSCCSSSCCCSSSCCSCSSCCCCCCCCCCSCCSCCCCSSCSSCCCCCCTTCSSSSCCSSSSSSCCCCCSSCSCCCSCCCCSSSTTCSCSSCCCSSCSCCCSSCCCCSCSSCSSCCCCCCCCCCSSSCCCCSSCCCSCCCSCCSCCSCCSSCCSCCCCCCCCCSCCCCCCCCSCCCCCCCSCCCSCCCCSSCSSCCCCCCCSSCCSCCSCCCCCCSTTTCSTTCCSSSCSCCSSSCSCCCSCSSCCSSCSCCCCSSCCCSCSCSSCSSCCSCCCSCCSSSSCSCCCCSSCCCCCSSCSSCSSSSCCSSCCCCCCCCCCCTTTCCCSSCCSSCSSCCSCCCCCSSSCCSCCSSCCCCCSSSCCCSCSCSCCCCTTCSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCSSSCSCCCCCCCSCCCCCCCSSSCCSSSCSSCSSSCSCSSSCCSCCCSSCCCCSCCCCCCCCCSCCSSSCCTTSSSCCCSSCCCCSSCCCCCCCSSCCCCSSCCSCSSCSSSCCCSSCSSSSCCCSCCCSCCCCCCCCCCCCCSCSCSCSSCSSSCCCSSSSTTSCSCCCCSSCCCCCCCCCCSSSCCSSCCCCSCCCCCCCCCSSSSSCSSSSCCCSSCCCCCSSSSCCSCCCCCCCCCSSSSCCCSSCCCCCSCCCSSCCCCCCCCSSCSSSCSCCCCCCCCCCCSCCSCCSSSSCCCCSCCSCSSSCCSCCCCCCCCCSSSCCCCCCCSCCCCCCCCCCCSSSSCSCCCSSSSCSSSSSSCCCCCCCSCCCSCCCSSCSSCCSCCSSCSSCCCCCSSCCCCCCSSSCCSSCSSSSSCCCSSCSCCCCCSSCSCSSCCSSSCCCCSCSSCSSSCCCCCCCSSCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSSSCCCCCCCSSSSSCCCCCSSCCSCCCSSCCCSSCCSCSSSSCCCSCCSSSSCCCCCCCSSSSCCCSCSCCCCSCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCCCCCCCCSSCSSSCCSSCCCCCCCSCCCCSSSCCCCCCCCCCCCCCSSCSCSCCSCCSSSSSCCTTCCTTCCCSSCCCCCSSCSCCCCSCCSSSSCCCSSCCCCCCSSSCCCCCCSSCSSCSCCSSSCCSSSCSCCSSCSSCSSCCCCCCCCCCCSSCCCCCCSSSSSCCCSCSCCCCCC

; Pleas cite the following papers:
; Souza, P C T; Alessandri, R; Barnoud, J; Thallmair, S; Faustino, I; Grünewald, F; Patmanidis, I; Abdizadeh, H; Bruininks, B M H; Wassenaar, T A; Kroon, P C; Melcr, J; Nieto, V; Corradi, V; Khan, H M; Domański, J; Javanainen, M; Martinez-Seara, H; Reuter, N; Best, R B; Vattulainen, I; Monticelli, L; Periole, X; Tieleman, D P; de Vries, A H; Marrink, S J; Nature Methods 2021; 10.1038/s41592-021-01098-3

[ moleculetype ]
molecule_0 1

The molecules are not connected. I tried with the martini2 version and it worked correctly. But for martini3 it shows like this.